大師堂と連結した納経所は、弘法大師の礼拝殿となっており、お大師様はこの建物内から上に向かって礼拝します。ここでは御朱印、おみくじ、お守りを受けることができるほか、遍路巡拝用品一式を揃えることが出来ます。